从九十年代开始,科幻电影配乐更多的和流行音乐结合起来。最典型的例子是掀起新一波赛博朋克电影浪潮的《黑客帝国》,它在使用经典好莱坞配乐的同时,又大量采用了另类摇滚乐队如Rammstein,RageAgainst The Machine,Marilyn Manson和疯克电子乐队如TheProdigy的作品,它们制造了传统配乐所无法达到的颠覆反叛效果。另一个出色的科幻电影配乐例子是法国导演吕克·贝松在好莱坞拍摄的科幻电影《第五元素》。该片的作曲家是吕克·贝松长期搭档法国人埃里克·塞拉(Eric Serra)。塞拉年轻时曾热衷于七十年代颇为流行的融合爵士乐,其最大的特点就是将任何类型的音乐融进爵士乐的框架中进行演奏,这极大的帮助了塞拉后日的电影音乐创作。